臺北市立敦化國民中學：核定總班級數 73 班〈包括普通班69班、特殊教育班3班、分散式學習資源班1班〉，下設 3 處 3 室。
- 校長室:綜理全校業務事項。
- 教務處:負責課程教學、學籍管理、實驗研究與教學設備等業務及其有關事項業務。
- 學生事務處:負責學生活動、生活輔導、生活教育、衛生保健及體育活動等業務及其有關事項業務。
- 總務處:校內公物維修管理、校舍及財產管理、環境綠美化、公文及檔案管理等業務及其有關事項業務
- 輔導室: 負責學生學習及生涯發展輔導、特殊教育等業務及其有關事項業務。
- 會計室: 負責辦理歲計、會計等事項。
- 人事室: 負責辦理人事管理事項。